農產品加工的免稅發(fā)票可以抵扣，稅務機關會根據(jù)農產品加工行業(yè)的營業(yè)稅收入抵扣依據(jù)。在扣除過程中，由于免稅的營業(yè)稅，企業(yè)的營業(yè)收入除去營業(yè)稅后的其他稅款收入，均可進行抵扣。具體步驟來說，先要將營業(yè)稅收入抵扣，其次，從未減去營業(yè)稅以外的收入中，將剩下的稅款減至零。 拓展知識：目前在我國，很多企業(yè)都采用農產品加工行業(yè)的收入抵扣措施，這種措施可以減輕企業(yè)的稅收負擔，促進企業(yè)投資，提高企業(yè)發(fā)展和改善農業(yè)結構，是一種積極的行政手段。另外，根據(jù)企業(yè)的具體情況，稅務機關可以對企業(yè)的營業(yè)稅收入進行進一步抵扣，以減輕企業(yè)的財務負擔。