是的，在計(jì)算非居民企業(yè)的應(yīng)納稅額時(shí)，需要考慮稅收協(xié)定。稅收協(xié)定是兩個(gè)或多個(gè)國(guó)家之間為了協(xié)調(diào)彼此的稅收管轄權(quán)和避免雙重征稅而簽訂的協(xié)議。對(duì)于非居民企業(yè)而言，稅收協(xié)定通常會(huì)規(guī)定其來(lái)源國(guó)（即企業(yè)收入來(lái)源的國(guó)家）和居民國(guó)（即企業(yè)注冊(cè)或?qū)嶋H管理所在的國(guó)家）之間的稅收待遇。

在計(jì)算非居民企業(yè)的應(yīng)納稅額時(shí)，稅收協(xié)定可能會(huì)影響以下方面：
1. 稅收管轄權(quán)：協(xié)定可能會(huì)明確規(guī)定哪一國(guó)家對(duì)哪些類(lèi)型的收入擁有征稅權(quán)。
2. 稅率：協(xié)定可能會(huì)規(guī)定一個(gè)低于普通稅率的優(yōu)惠稅率，或者特定的征稅條件。
3. 稅收抵免：協(xié)定可能允許企業(yè)在其居民國(guó)享受稅收抵免，以避免雙重征稅。
4. 預(yù)提稅：協(xié)定可能會(huì)規(guī)定一個(gè)較低的預(yù)提稅稅率，適用于支付給非居民企業(yè)的股息、利息和特許權(quán)使用費(fèi)等。
5. 常設(shè)機(jī)構(gòu)：協(xié)定可能對(duì)常設(shè)機(jī)構(gòu)的定義和征稅規(guī)則有具體規(guī)定。

因此，在計(jì)算非居民企業(yè)的應(yīng)納稅額時(shí)，需要根據(jù)適用的稅收協(xié)定來(lái)確定企業(yè)的納稅義務(wù)和享受的稅收優(yōu)惠。如果不考慮稅收協(xié)定，可能會(huì)導(dǎo)致企業(yè)被錯(cuò)誤地征稅，或者未能享受到應(yīng)有的稅收優(yōu)惠。