自由貿(mào)易試驗區(qū)外商投資國家安全審查的程序包括以下步驟：
1. 提交申請：外商投資者需要向自由貿(mào)易試驗區(qū)的管理機構(gòu)提交外商投資申請，同時提供相關的文件和資料。
2. 受理審查：管理機構(gòu)會對申請進行受理審查，檢查申請材料是否齊全和符合要求。
3. 審查決定：管理機構(gòu)會根據(jù)申請情況進行審查，并作出是否需要進行國家安全審查的決定。
4. 國家安全審查：如果決定需要進行國家安全審查，管理機構(gòu)會將申請材料提交給國家安全審查機構(gòu)進行審查。
5. 審查結(jié)果：國家安全審查機構(gòu)會對申請進行審查，并作出是否批準的決定。審查結(jié)果將通知管理機構(gòu)。
6. 決定通知：管理機構(gòu)會將國家安全審查的決定通知外商投資者。
7. 實施決定：根據(jù)審查結(jié)果，外商投資者可以根據(jù)決定繼續(xù)進行投資或進行必要的調(diào)整。

需要注意的是，不同自由貿(mào)易試驗區(qū)的具體程序可能會有所不同，外商投資者應根據(jù)相關規(guī)定進行申請和操作。此外，國家安全審查的具體標準和程序也可能會根據(jù)實際情況進行調(diào)整和變化。