可以。雖然總公司付款，但分公司是實際接受服務(wù)的主體。不過最好簽訂三方協(xié)議，明確總公司代付，代理公司向分公司開具發(fā)票，同時總公司和分公司內(nèi)部也要完善相關(guān)手續(xù)，避免稅務(wù)風(fēng)險。