如果總分公司在季度申報時備案了合并申報企業(yè)所得稅，在填寫財務報表時一般應合并填寫。 原因如下：既然選擇了合并申報企業(yè)所得稅，就意味著將總分公司作為一個整體進行稅務處理。財務報表也應反映這個整體的財務狀況和經(jīng)營成果，以便與合并申報的企業(yè)所得稅相匹配。 例如，資產(chǎn)負債表應合并反映總分公司的資產(chǎn)、負債和所有者權益總額；利潤表應合并反映總分公司的收入、成本和利潤情況。