具體怎么處理呢

就是多記一些收入成本或者費用。

那我是在之前的成本和費用上調嗎？現在已經處于零申報狀態(tài)

就是調原來的成本和費用。

就做一張憑證來沖平就可以了嗎？借：應交稅費-應交所得稅 借：管理費用（紅字）這樣嗎？

這樣調整可以，然后寫一個調整說明。