事業(yè)單位企業(yè)所得稅匯算清繳的時間是每年的3月1日至5月31日。在這段時間內(nèi)，事業(yè)單位需要對上一納稅年度的企業(yè)所得稅進(jìn)行匯算清繳，同時還需要填寫《企業(yè)所得稅年度納稅申報表》和《企業(yè)所得稅匯算清繳申報表》，并在稅務(wù)機(jī)關(guān)進(jìn)行申報和繳納稅款。