小規(guī)模納稅人在處理增值稅專用發(fā)票和普通發(fā)票的差異時，需要注意以下幾點：
1. 稅率差異：增值稅專用發(fā)票和普通發(fā)票的稅率可能不同，小規(guī)模納稅人需要根據(jù)不同稅率進行相應(yīng)的處理。
2. 抵扣范圍差異：增值稅專用發(fā)票可以用于抵扣進項稅，而普通發(fā)票只能用于抵扣部分進項稅。小規(guī)模納稅人需要根據(jù)不同的抵扣范圍進行相應(yīng)的處理。
3. 納稅申報方式差異：小規(guī)模納稅人在納稅申報時，需要將增值稅專用發(fā)票和普通發(fā)票分別列出并填寫相應(yīng)的信息。
4. 發(fā)票認證方式差異：增值稅專用發(fā)票需要進行發(fā)票認證，而普通發(fā)票不需要。小規(guī)模納稅人需要根據(jù)不同的認證方式進行相應(yīng)的處理。

綜上所述，小規(guī)模納稅人需要根據(jù)增值稅專用發(fā)票和普通發(fā)票的差異進行相應(yīng)的處理，以確保納稅申報的準確性和合法性。