醫(yī)療期內(nèi)是否扣工資，要根據(jù)具體情況而定。根據(jù)《勞動法》規(guī)定，員工因病需要請假治療的，用人單位應(yīng)當(dāng)按照下列規(guī)定支付工資：
1. 對于工傷或者因工作原因患職業(yè)病的，用人單位應(yīng)當(dāng)按照國家規(guī)定支付工傷保險待遇；
2. 對于非因工傷或者非因工作原因患病的，用人單位應(yīng)當(dāng)按照下列規(guī)定支付工資：
（1）醫(yī)療期內(nèi)，用人單位應(yīng)當(dāng)按照本人工資的百分之八十支付工資；
（2）醫(yī)療期滿，本人仍然不能工作的，用人單位應(yīng)當(dāng)按照本人工資的百分之八十支付工資，直至其能夠工作為止。

因此，如果員工請假治療是因為非工傷或者非因工作原因患病，用人單位應(yīng)當(dāng)按照員工工資的80%支付工資。如果員工請假治療是因為工傷或者因工作原因患職業(yè)病，用人單位則應(yīng)當(dāng)按照國家規(guī)定支付工傷保險待遇。